Шмуэль получил традиционное еврейское образование. В 15 лет Могилевер женился, а в 18 лет стал раввином и впоследствии служил раввином в синагогах нескольких городов губернии. Параллельно с этим Могилевер управлял собственной компанией, занимающейся торговлей. Могилевер считался одним из лучших знатоков Талмуда своего времени. При этом он увлекался светскими науками и в споре еврейской интеллигенции о современном образовании и традиционном еврейском утверждал, что вера и наука должны быть взаимодополняющими. Еще до погромов 1881–1883 годов Шмуэль выступал за переселение евреев на Землю обетованную, а после занимался поддержкой вынужденных беженцев во Львове и Бродах. Могилевер стал одним из тех, кто убедил барона Ротшильда поддержать поселения евреев в Палестине, среди которых было и основанное в 1883 году выходцами из России сельскохозяйственное поселение Экрон. Могилевер был автором многочисленных работ, по большей части уничтоженных во время Белостокских погромов в 1906 г.