Однако первый камень был заложен только 24 июля 1918 г. на горе Скопус, при участии видных сионистских деятелей, глав британской власти и представителей арабской общины.

Строительство было завершено в 1925 г., а преподавание началось только в 1928 г.

Среди учредителей университета были крупнейшие еврейские учёные и мыслители — Альберт Эйнштейн, Зигмунд Фрейд, Мартин Бубер.

До 1948 г. преподавание велось на горе Скопус. В 1939 г. году рядом с университетом была открыта университетская больница Хадасса, как часть проекта открытия медицинского факультета.

После Войны за независимость она оказалась израильским анклавом на территории Иордании, и далее продолжать учёбу в этом здании стало невозможно.

Факультеты университета временно расположились в разных зданиях в Иерусалиме, пока в 1953 г. не началось строительство нового кампуса в Гиват Раме. Больница Хадасса и медицинский факультет были открыты заново в 1961 г. в новом кампусе  недалеко от района Эйн Карем.

В 1967 г. после Шестидневной войны учёба возобновилась на горе Скопус, и гуманитарные  факультеты открылись там. Еврейский Университет занимает  высокое место  в рейтинге мировых университетов и считается лучшим университетом Израиля.

Альберт Эйнштейн завещал Еврейскому университету все свои письма и рукописи, а также копирайт на коммерческое использование своего образа и имени