28 сентября на улицах Киева был расклеен приказ: на следующий день, в 8 утра, всем евреям города собраться на углу улиц Мельника и Дегтяревской; за неявку немцы угрожали расстрелом. По городу ходили разные слухи, в том числе и тот, что евреев собираются вывезти в Палестину, и поэтому многие решили пойти.

Наутро, 29 сентября, собравшихся евреев повели по улице Мельника. Сначала шли свободно; однако на перекрестке улиц Мельника и Пугачёва людей поджидали эсэсовцы с автоматами и местные полицаи, они брали их под конвой и обратно уже не пускали. Дорога вела к кладбищу. Около кладбища приказывали остановиться, отбирали документы и вещи, и дальше гнали партиями по 500-600 человек. На улице Дорогожицкой, идущей вдоль кладбища, эсэсовцы с собаками образовывали коридоры и избивали всех проходящих по ним.

В конце пути несчастные люди оказывались на широкой площадке, отделенной от оврага, носящего название Бабий Яр, недавно сооруженной земляной насыпью; самого оврага им не было видно. Площадка была оцеплена украинской полицией. Здесь всем приказывали быстро раздеться и так же быстро бежать через узкие проходы, проделанные в насыпи. Все приказы сопровождались избиениями. Пробежав такой коридор – а остановиться было невозможно, потому что сзади напирали другие – человек оказывался на уступе, сделанном на склоне оврага. На противоположном склоне стояли пулеметы, из них эсэсовцы айнзацкоманды 4а группы «С» косили очередями людей, появлявшихся из проходов в насыпи. Убитые, раненые и просто оглушенные люди падали на дно оврага.

Таким образом, за два дня немцы уничтожили 33771 евреев Киева, вдобавок к расстрелянным в первые дни оккупации города.